1、按用途可分為：小體積樣品全自動(dòng)固相萃取儀和大體積樣品全自動(dòng)固相萃取儀
小體積樣品指食品、藥品等樣體，體積量一般在50ml以下;而大體樣品主要指水樣，一般是200ml量以上。市面上現(xiàn)有的全自動(dòng)固相萃取儀也是通過(guò)樣品量的體積不同而設(shè)計(jì)。
2、按原理分可分為柱萃取和膜萃取全自動(dòng)固相萃取儀
膜萃取主要為大體積水樣而設(shè)計(jì)的，膜萃取速度快是其優(yōu)點(diǎn)，而且不容易堵塞，但是單個(gè)樣品的處理成本較柱萃取高。
3、按通道分可分為單通道和多通道固相萃取儀
其中聚同電子系列的固相萃取儀分為普通固相萃取儀和全自動(dòng)固相萃取儀，通道數(shù)普通固相分為12/24通道，全自動(dòng)固相風(fēng)味6/8通道
通常通道數(shù)量越多，在處理大批量樣品時(shí)，就可以節(jié)約更多的時(shí)間，特別是上樣的時(shí)間。